Alterre Bourgogne-Franche-Comté a pour ambition de contribuer, à l’échelle de la grande région, à une transformation qualitative des relations entre les hommes, et entre les hommes et leur environnement, vers un développement soutenable.

L'agence poursuit quatre grands objectifs :

• Améliorer la connaissance
• Construire une culture commune
• Favoriser la mise en pratique du développement durable
• Repérer les enjeux de demain